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1980年公司成立之初，未有内设机构。1982年3月，公司正式成立内设科室。30年来，内设科室随着公司发展的需要时有增设和撤并。
企业管理办公室
主要职责 企业管理办公室是公司领导班子管理企业的办事机构，其主要职责为：全面了解企业综合情况和上级有关方针政策；文字材料的起草、编印、传发、存档等；行政会议的组织和服务工作；印章的使用管理；车辆调度、油料发放等管理工作；办公设施、物品的使用和管理工作。
联系电话：2172008
人力资源部
主要职责 承担公司党的建设、精神文明建设、思想政治建设、党风廉政建设、信访稳定工作和纪检监察的日常工作，负责公司劳动人事工作。
财务审计科
主要职责 在经理领导下做好公司财务管理和会计核算的各项工作，建立健全公司经济核算体制，达到制度化、规范化、科学化；参与公司经济合同签订、工程审核验收；积极进行财政法规的宣传，严格执行各项财务工作的法规，及时向上级提交财务报告和各项改进工作的建议、措施。妥善保管会计凭证、报表、帐簿和档案资料。
管线所
主要职责 管线所是公司各类管线的管理机构，主要职责为管网维护、测漏、抄表、抢修。
营业所
主要职责 营业所负责公司供水服务的日常工作，办理供水、停水、过户手续和全市用水户的水费、审核、水费计算、水费回收等工作。
第一净水厂
新泰市自来水公司第一净水厂始建于1989年，1991年2月建成投入使用，占地面积25亩，设计规模为日供水3万吨，水厂水源取自水质优良的位于城区东北四公里的金斗水库。水厂建有滤站、加氯间、清水池、泵房、反冲洗水塔与中心调度室、中心化验室和办公于一体的综合楼，总建筑面积4000多平方米，装机总容量960kw。泵房配有变频调度设备，中心调度室配有大型电子显示屏。全城设有七个自动传感测压点，整个供水系统实现了恒压供水。2004年对滤池进行了技术改造，由大阻力配水系统改成滤板滤头的小阻力配水系统，滤料由石英砂、无烟煤的双层滤料改为单一石英砂均质滤料。2005年对水厂消毒工艺进行了改造，由原来的氯气消毒改为二氧化氯消毒。上述两项技改提高了供水水质，水质综合合格率一直保持在98%以上。2009年～2010年，公司又投资1000余万元，对该厂进行了全面技术改造。
清润净水厂
主要职责 整个净水厂工程由配水楼、两个澄清池、两个滤池、两个清水池、二级泵池，综合楼与引水、供水、排水管网系统等部分组成，建筑形式为集中、组合式构筑体。此水厂利用系统工程和价值工程指导，采用高效节能给水处理新理论、新技术研制成的新构筑物组合的工艺流程。实施进水流量自动调节与二级供水潜水泵调频联动运行指标，电脑显示储存和记录，并配备原水和出厂水的自动在线监测，并在水厂安装原水流量计GSM远程监测系统，对取水口处的水量数据进行传输。对现场时时在线监测，各项数据传输及时准确，设备运转正常。
生产技术科
主要职责 全面负责公司的生产技术、设备管理的相关工作，搞好公司各项工程的勘察设计、图纸会审、方案制定和监督验收；负责新设备、新工艺的技术咨询论证、安装调试和所有设备的维护和技改等工作；抓好技术培训，不断提高职工技术素质。
稽查科
主要职责 负责国家城市供水政策法规的宣传和贯彻执行，制定本区域内相关的政策、法规，并认真贯彻执行；搞好供水稽查工作，及时完成上级交办的其他各项任务。
水质检验科
主要职责 负责公司自来水厂、富氧水厂的原水、出厂水、管网及管网末梢水等各类水质的化验分析，及时提供各类准确水质信息，加强水质的监管，保证生产的各类水质达到国家规定的标准，负责各水源地的卫生防护，保证水源符合国家规定标准，大力进行自来水质法律法规的普及宣传。
计划生育办公室
主要职责 负责公司计划生育工作的全面开展，搞好公司生育人口的管理教育，完成计生工作的各项任务；搞好计划生育国策的宣传，不断提高公司全体职工的素质；配合属地管理，完成有关方面交办的计划生育工作的各项任务。
工会办公室
主要职责 负责工会、职教、共青团的日常工作，组织实施；在工会主席领导下开展工作，当好领导的参谋和助手；负责开展有益职工身心健康的文体活动；搞好场所用具的管理；搞好离退休职工日常管理和慰问等；负责收集和反映职工的合理化意见、要求；搞好企务公开；积极参加精神文明建设，不断提高职工队伍的政治和业务素质。
供应科
主要职责 负责全公司的物资采购和供应，对物资供应不及时或质量不符合标准造成的贻误生产由供销科负责，负责制定物资采购计划和储备资金定额，提高周转率，降低保管损耗。负责签订物资购货合同，遵守国家法规和政策，尽量以较低的费用供应生产需用物资。
保卫科
主要职责 负责公司安全保卫的各项工作，搞好封闭式管理，协同有关部门建立健全社会治安综合治理机构，搞好普法教育。负责户籍管理和民兵、消防等各项相关工作，积极参加精神文明建设，开展安全教育，并及时完成领导交给的其他各项任务。
安装工程公司
主要职责 安装工程公司全称为新泰市自来水安装工程公司，是公司所属的管道安装机构。主要负责公司所属自来水管线的勘测、设计、安装；对外承接各类管道安装任务。
富氧水厂
主要职责 该厂坚持以质量求生存，以服务促发展，在新泰城乡建立了系统的销售网络。2005年6月，在山东省质量技术监督局组织的山东省质量监督抽查中，该厂被评为产品质量合格企业，并在《中国质量报》上进行了公告。自该厂成立以来，以质量和服务赢得了广大消费者的热烈欢迎，并成为公司发展的重要产业和知名品牌。2008年10月，全国竞走锦标赛组织委员会指定为竞赛专用饮用水。
水表校验中心
主要职责 负责对公司各类水表的校验，保证计量准确；对广大用户开展服务，校验用户的各类水表。
户表办
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